一昨年に住宅を購入し住宅ローン控除を受けたのですが、昨年は所得金額が3,000万円を超えてしまったため受けられませんでした。
本年は、勤務先からの転勤命令で転居することになったのですが、将来、住宅に再入居した場合には、住宅ローン控除の再適用は受けられるのでしょうか？

住宅ローン控除の再適用というのは、住宅ローン控除の適用を受けていた居住者のみが受けられることになっています。

このとき、住宅を居住用に使用しなくなる日の属する年の前年まで、継続して住宅ローン控除の適用を受けているかどうかというのは要件にはなっていません。

ご質問の場合は、 一昨年に住宅ローン控除を受けていますので、他の要件を満たしているのであれば、昨年受けられなかったとしても、住宅ローン控除の再適用は認められます。

その場合には、住宅ローン控除の適用を受けていた居住者には該当しませんので、住宅ローン控除の再適用は受けられません。